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            小黃魚(yú)全基因組精細圖譜首次繪制

            發(fā)布時(shí)間:2022-12-01 16:50:00來(lái)源: 科技日報

              科技日報訊 (洪恒飛 王夏君 記者江耘)近日,科技日報記者從浙江省農業(yè)科學(xué)院(以下簡(jiǎn)稱(chēng)浙江省農科院)獲悉,該院水生生物研究所小黃魚(yú)科研團隊與廈門(mén)大學(xué)、美國奧本大學(xué)合作,首次完成了小黃魚(yú)全基因組組裝注釋與精細圖譜繪制,為建立小黃魚(yú)基因組選擇育種、培育高產(chǎn)抗病優(yōu)質(zhì)良種提供了基因資源和技術(shù)手段。相關(guān)研究論文近日在線(xiàn)發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊《分子生態(tài)學(xué)資源》。

              小黃魚(yú)是中國重要的海產(chǎn)經(jīng)濟魚(yú),味道鮮美,廣受青睞。隨著(zhù)小黃魚(yú)全養殖產(chǎn)業(yè)的擴大和科研的深入,破譯小黃魚(yú)基因組,發(fā)掘其生長(cháng)、性別決定等相關(guān)重要功能基因成為擺在科研工作者面前的重要課題。

              “黃魚(yú)屬包含東海四大海產(chǎn)中的小黃魚(yú)與大黃魚(yú)兩個(gè)重要經(jīng)濟魚(yú)類(lèi),雖然它們形態(tài)和染色體核型相似,但是黃魚(yú)屬物種之間的遺傳關(guān)系尚未明確。”論文第一作者、浙江省農科院水生生物研究所(以下簡(jiǎn)稱(chēng)水生所)助理研究員謝慶平博士介紹,本研究結合4類(lèi)基因組測序技術(shù),構建了小黃魚(yú)染色體水平的基因組精細圖譜;揭示小黃魚(yú)基因組大小為706兆,注釋基因為25233個(gè);進(jìn)化分析表明小黃魚(yú)與大黃魚(yú)親緣關(guān)系最近,大概在2540萬(wàn)年前開(kāi)始分化。

              謝慶平介紹,魚(yú)類(lèi)雌雄同體和雌雄異體的演化方向,在學(xué)術(shù)界仍然是一個(gè)有待解決的有趣謎團。此次研究通過(guò)轉錄組學(xué)、比較基因組學(xué)以及分子生物學(xué)的技術(shù)方法,鑒定出dmrt1基因為小黃魚(yú)的雄性特異性基因,且dmrt1基因序列的演化可以作為魚(yú)類(lèi)中雌雄同體現象產(chǎn)生的生物標記。

              論文通訊作者、浙江省農科院水生所所長(cháng)樓寶研究員表示,小黃魚(yú)全基因組的解譯和基因組精細圖譜的繪制,對于海洋漁業(yè)資源保護、小黃魚(yú)養殖產(chǎn)業(yè)化以及分子遺傳育種技術(shù)的研究意義重大。

            (責編:陳濛濛)

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